أعنلت "هيئة تحرير الشام"، "رفضها لمخرجات مؤتمر أستانة 6 وما جاء فيها"، مشيرةً إلى أنّ "حضور مؤتمرات التفاوض ليس حقّاً لمن حضر، وهم غير مفوّضين بذلك".
ولفت مسؤول العلاقات الإعلامية في "هيئة تحرير الشام"، عماد الدين مجاهد، إلى أنّ "مؤتمر أستانة لا يحقّق أهداف الثورة، بل يهدف إلى تجميد القتال وتسوية الوضع مع الجيش السوري عبر مراحل متعدّدة بدأت بإيقاف إطلاق النار وستنتهي بإعادة المناطق لسيطرة الجيش السوري".
ونوّه إلى أنّ ""هيئة تحرير الشام" تستغرب وبشدّة قبول الفصائل الّتي حضرت في المؤتمر بتصريحات الوفد الروسي، الّتي نصّت على قتال كلّ من يقاتل الجيش السوري، وتخشى أن يأتي اليوم الّذي تصطف فيه تلك الفصائل إلى جانب الطيران الروسي وتقاتل من يقاتل الجيش السوري".