إعتبرت مؤسسة مياه ​البقاع​ انه "بعد التقرير الصادر عن المركز الوطني لجودة الدواء والغذاء والمواد الكيميائية في ​الجامعة اللبنانية​، والذي نشرته احدى الصحف وتناقلته مواقع اخبارية عن تلوث للمياه في بعض الأماكن في البقاع ممن المؤسف أن يتم نشر هذا التقرير، بغض النظر عن دقته العلمية وموضوعيته وأهدافه، في وسائل الإعلام قبل إطلاعنا عليه ومناقشتنا بمضمونه ونتائجه".

ورأت المؤسسة أن "بعض المواقع المذكورة في التقرير، لجهة المصادر والشبكات، لا تقع في النطاق الاستثماري للمؤسسة، وبالتالي لا نتحمل المسؤولية عنها"، مؤكدة أن "​المياه​ التي تقوم بتوزيعها من 242 خزانا، تتم تغذيتها من 42 نبعا و230 بئرا، تخضع لفحوصات دورية دقيقة في مختبراتها للتأكد من سلامتها وصلاحيتها للاستهلاك"، مضيفة:"يقوم موظفو المؤسسة بأخذ عينات يوميا من مختلف الأماكن في المدن والقرى يتم فحصها بإشراف اختصاصيين للتأكد من مطابقة المياه للمعايير الصحية الوطنية. وعند اكتشاف أي تلوث تقوم الفرق الفنية بمعالجته دون ابطاء".

وكشفت المؤسسة أن "شبكات المياه في البقاع، وهي بطول 565 كيلومترا تتعرض للتعديات المختلفة الأشكال والأنواع مما يؤثر على سلامة المياه في بعض الأماكن. وفي ظل النقص الكبير في عدد الموظفين تراهن المؤسسة على تعاون البلديات و​القوى الأمنية​ لمنع هذه التعديات"، مؤكدة " استعدادها الدائم للتنسيق مع كل الجهات المعنية الجدية والمسؤولة لتأمين المياه النظيفة والعذبة لكل المشتركين".