إنتقد الرئيس التركي، ​رجب طيب أردوغان​ معارضي تحويل ​آيا صوفيا​ إلى مسجد، مشيرا إلى أنهم "من الممكن أن يقدموا مقترحا بتحويل مسجد السلطان أحمد إلى متحف، ومن المؤكد أن نفس هذه العقلية من الممكن أن تتقدم بمقترح لتحويل مسجد السلطان أحمد، درة مساجد ​إسطنبول​ إلى متحف".

ولفت إلى أن "هذه العقلية في الماضي، فكرت في استخدام هذا المسجد كمعرض للصور، وقصر يلديز كدار للقمار، وآيا صوفيا كناد لموسيقى الجاز، حتى أنهم نفذوا بعض هذه الأمور، وجهة النظر هذه كعادتها في كل الفترات ما هي إلا مظهر من المفاهيم المناهضة للعصرية التي تنضوي تحت ما يسمى بالحداثة، وما الإصرار على غلق ​الفاتيكان​ وتحويله على متحف، والإبقاء على آيا صوفيا كمتحف، إلا نتاج نفس المنطق".

ولفت إلى أنه "لا نستغرب إذا ما نادى هؤلاء لاحقا بتحويل الكعبة التي هي أقدم دار عبادة أو ​المسجد الأقصى​ إلى متحف".