قدم المرشد الإيراني الاعلى السيد ​علي خامنئي​ التعازي باغتيال ​العالم​ النووي محسن فخري زاده. واشار الى انه "على المسؤولين المعنيين متابعة جريمة الاغتيال ومحاسبة مرتكبيها ومن يقف وراءها ومتابعة الجهود العلمية".

واعتبر خامنئي بان "العالم فخري زاده اغتيل على يد المرتزقة المجرمين الجناة الأشقياء". ولفت الى ان العالم فخري زاده هو أحد العلماء البارزين المميزين في المجالين النووي والدفاعي، وهو عنصر علمي فريد قتل في سبيل الله لجهوده ومساعيه العلمية العظيمة.